A Igreja de Santa Cristina situa-se ao lado do Claustro do Convento dos Franciscanos de Varatojo, atual edifício dos Paços do Concelho.
A antiga igreja de Santa Cristina foi destruída pelas tropas do general Loison, aquando da II Invasão Francesa, em 1809, restando apenas a torre que é visível do Passeio Alto.
Os paroquianos de Santa Cristina, logo que os frades franciscanos do convento saíram, no dia 28 de Maio de 1834, apropriaram-se da igreja de Nossa Senhora da Piedade, anexa ao convento, convertendo-a na nova igreja matriz, que passou a denominar-se Igreja de Santa Cristina.